最常见的不良反应包括：胃肠道系统（便秘、恶心）、水肿（包括外周水肿、全身水肿、眼睑水肿、眶周水肿）、肌痛（包括肌痛和肌肉骨骼疼痛）、肝脏系统损伤（胆红素升高）、贫血、皮疹（包括皮疹、斑丘疹、痤疮样皮炎、红斑等）。一般轻度症状对症治疗，严重症状时应及时就医。
间质性肺病（ILD）/非感染性肺炎：
应注意监测，有症状的患者建议及时就医，确诊的患者应立即暂停阿来替尼的治疗，如果没有发现其他ILD/非感染性肺炎的潜在病因，则应永久停药。
肝脏毒性：
一般在最初服药的3个月内发生肝脏损伤，通常根据不良反应的严重程度降低剂量或停药。所以建议定期监测肝脏功能（包括ALT、AST和总胆红素），在最初服药的3个月内每两周监测一次，对肝脏功能指标有变化的患者还要进行更频繁的监测，指标异常时要立即就医。
肌痛和肌磷酸激酶（CPK）升高：
建议在用药的第一个月每两周监测一次CPK水平，随后定期监测，还要注意有任何原因不明的肌痛都要立刻就医。根据CPK升高的严重程度停止药物治疗，等水平恢复正常后恢复治疗或降低剂量服用。
肾脏毒性和心动过缓：
轻度时不需要调整剂量，严重时需要立即就医，可能需要减少服用剂量或暂停服药。
目前阿来替尼是治疗ALK阳性患者的首选靶向药，依旧有多种不良反应值得注意，患者碰到严重的不良反应时要立即询问医生或药师，不要自行改变服药剂量。
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