目前腺病毒载体已被广泛应用到疫苗研发中。军事医学科学院生物工程研究所与康希诺生物联合研发的埃博拉疫苗就是以腺病毒5型（Ad5）作为载体，目前已完成Ⅰ期和Ⅱ期临床试验，显示了良好的安全性和免疫原性；美国强生旗下杨森制药研发了一种Ad26载体的埃博拉疫苗，已完成Ⅲ期临床试验。

在针对新型冠状病毒（简称“新冠病毒”）的疫苗研发中，腺病毒载体疫苗的研究进展也处于前列。根据2020年9月9日世界卫生组织（WHO）发布的官方文件，进展最快的9支疫苗中有4支疫苗是重组腺病毒载体疫苗，已进入了Ⅲ期临床试验。

阿斯利康和牛津大学联合研发的ChAdOx1腺病毒载体新冠病毒疫苗正在英国、印度、巴西开展Ⅲ期临床试验；康希诺生物和中国军事医学科学院生物工程研究所联合研发的Ad5腺病毒载体新冠病毒疫苗正在俄罗斯、巴基斯坦等地进行Ⅲ期临床试验；俄罗斯Gamaleya研究所研发的腺病毒载体新冠病毒疫苗在俄罗斯境内多地进行Ⅲ期临床试验；杨森制药研发的Ad26COV2.S腺病毒载体新冠病毒疫苗正在美国、巴西、智利等地开始Ⅲ期临床试验。

虽然目前尚无腺病毒载体疫苗正式获批上市，但腺病毒作为载体有很高的临床应用价值，针对新冠病毒的腺病毒载体疫苗也是现在研发较多、进展最快的类型之一。